| Did you know ... | Search Documentation: |
 | Packs (add-ons) for SWI-Prolog |
- Home
- DOWNLOAD
- DOCUMENTATION
- TUTORIALS
- Beginner▶
- Advanced▶
- Web applications▶
- Semantic web▶
- Graphics▶
- Machine learning▶
- External collections▶
- For packagers▶
- COMMUNITY
- USERS
- WIKI
Package "biomake"
| Title: | Prolog makefile-like system |
|---|---|
| Rating: | Not rated. Create the first rating! |
| Latest version: | 0.1.5 |
| SHA1 sum: | df6aea2fa2190ffe1741464b1b3993ef49206c80 |
| Author: | Chris Mungall <cmungall@gmail.com> |
| Ian Holmes <ihh@berkeley.edu> | |
| Packager: | Chris Mungall <cmungall@gmail.com> |
| Home page: | https://github.com/evoldoers/biomake |
| Download URL: | https://github.com/evoldoers/biomake/releases/*.zip |
Reviews
No reviews. Create the first review!.
Details by download location
| Version | SHA1 | #Downloads | URL |
|---|---|---|---|
| 0.1.1 | 97679a834ab42d1656d4a6ab2a4e424a0143806e | 1 | http://github.com/evoldoers/biomake.git |
| ae8c24ef675733f9dfcf0f72c2c258c1c74c7148 | 3 | http://github.com/evoldoers/biomake.git | |
| ef3def3010d047578750d90eabcd29b1e6f75983 | 1 | https://github.com/evoldoers/biomake/archive/v0.1.1.zip | |
| 0.1.3 | 15edc831b18333e42f513afdfd0fc186c82860c9 | 3 | https://github.com/evoldoers/biomake/archive/v0.1.3.zip |
| 0.1.5 | 04dbee27e3a4c3f64bbb021bef6a51c2e09a4536 | 2 | https://github.com/cmungall/plmake.git |
| df6aea2fa2190ffe1741464b1b3993ef49206c80 | 4 | https://github.com/evoldoers/biomake/archive/v0.1.5.zip |
Readme file README.md too large (28,766 bytes; maximum size is 20,000)
Contents of pack "biomake"
Pack contains 338 files holding a total of 213K bytes.
- .gitignore(31 bytes)
- .travis.yml(228 bytes)
- CHANGES.md(1.8K bytes)
- LICENSE(1.5K bytes)
- Makefile(913 bytes)
- README.md(28.1K bytes)
- bin
- biomake(834 bytes)
- swipl_wrap(483 bytes)
- examples
- ontology_alignment.pro(2.2K bytes)
- pack.pl(337 bytes)
- prolog
- biomake
- biomake.pl(38.3K bytes)
- cli.pl(14.7K bytes, not a module)
- embed.pl(838 bytes)
- functions.pl(12.3K bytes)
- gnumake_parser.pl(20.1K bytes)
- md5hash.pl(6.7K bytes)
- queue.pl(10.8K bytes)
- scan.pl(2.5K bytes)
- utils.pl(9.9K bytes)
- poolq
- poolq.pl(4.3K bytes)
- test
- justify-exception-workaround.pl(996 bytes, not a module)
- test.pl(20.8K bytes, not a module)
- biomake
- t
- dir
- ref
- Makefile.translated(1.0K bytes)
- abspath(46 bytes)
- add(9 bytes)
- addprefix(30 bytes)
- addsuffix(29 bytes)
- all_deps(21 bytes)
- altrules1.type1(106 bytes)
- altrules2.type1(149 bytes)
- always_make_with_missing_pattern_dep.test(8 bytes)
- and1(4 bytes)
- and2(1 bytes)
- append_recursive_var(18 bytes)
- append_simple_var(12 bytes)
- append_var(12 bytes)
- arg_equals_val(22 bytes)
- bad_function_syntax(1 bytes)
- bagof1(6 bytes)
- bagof2(1 bytes)
- bagof3(2 bytes)
- basename(22 bytes)
- braces_in_deplist(16 bytes)
- call(28 bytes)
- cmdline_eval1(94 bytes)
- cmdline_eval2(99 bytes)
- comment_in_deps(20 bytes)
- comment_in_rule(23 bytes)
- complex_ifeq(8 bytes)
- computed_var1(2 bytes)
- computed_var2(2 bytes)
- computed_var3(6 bytes)
- dcg_test(24 bytes)
- deltest(6 bytes)
- deltest2(9 bytes)
- dep_chain_one_step(13 bytes)
- dep_chain_two_step(13 bytes)
- dep_dir(7 bytes)
- dep_file(4 bytes)
- dep_linebreak(39 bytes)
- depgoal_a(12 bytes)
- depgoal_x(14 bytes)
- deps_dir(18 bytes)
- deps_file(10 bytes)
- dir(26 bytes)
- divide(10 bytes)
- embedded
- Makefile(388 bytes)
- human-mouse.pair(61 bytes)
- human-zebrafish.pair(69 bytes)
- human.single(14 bytes)
- mouse-zebrafish.pair(69 bytes)
- mouse.single(14 bytes)
- zebrafish.single(18 bytes)
- empty(0 bytes)
- empty_ifeq(8 bytes)
- envtest(6 bytes)
- envtest2(6 bytes)
- envtest3(6 bytes)
- envtest4(6 bytes)
- escape_dollar(2 bytes)
- escaped_nl2(11 bytes)
- expanded_phony_target(62 bytes)
- filter(15 bytes)
- filter_out(15 bytes)
- findstring1(7 bytes)
- findstring2(1 bytes)
- first_dep(7 bytes)
- firstword(6 bytes)
- flesh_and_bone_by_the_telephone(51 bytes)
- forced_rebuild(6 bytes)
- foreach(54 bytes)
- function_in_deplist(24 bytes)
- function_whose_args_are_both_expressions(13 bytes)
- head_and_dep_goals_a_b(19 bytes)
- head_and_dep_goals_a_x(26 bytes)
- head_and_dep_goals_x_b(26 bytes)
- head_and_dep_goals_x_y(26 bytes)
- headgoal_a(12 bytes)
- headgoal_x(14 bytes)
- hyphenated_var(28 bytes)
- i.am.the.garbage.flower(84 bytes)
- if1(4 bytes)
- if2(4 bytes)
- if3(4 bytes)
- if4(1 bytes)
- ifdef_false(26 bytes)
- ifdef_true(24 bytes)
- ifeq_dblquote(8 bytes)
- ifeq_false(20 bytes)
- ifeq_false_ifneq_true(20 bytes)
- ifeq_quote(8 bytes)
- ifeq_space1(8 bytes)
- ifeq_space2(8 bytes)
- ifeq_space3(8 bytes)
- ifeq_true(19 bytes)
- ifeq_true_ifneq_false(19 bytes)
- ifndef_false(26 bytes)
- ifndef_true(24 bytes)
- ifneq_false(20 bytes)
- ifneq_true(19 bytes)
- ignore(3 bytes)
- ignore_all(3 bytes)
- inc2.test(10 bytes)
- include_dir(13 bytes)
- iota(21 bytes)
- iota2(8 bytes)
- iota_add_multiply(12 bytes)
- join(27 bytes)
- keep_going(33 bytes)
- lastword(6 bytes)
- love.will.tear.us.apart(84 bytes)
- lower_case_variable.pltest(20 bytes)
- makecmdgoals(31 bytes)
- makefile_list(35 bytes)
- md5
- .biomake
- md5
- hello(115 bytes)
- hello_world(253 bytes)
- world(115 bytes)
- md5
- Makefile(64 bytes)
- hello(6 bytes)
- hello_world(12 bytes)
- world(6 bytes)
- .biomake
- md5.len
- .biomake
- md5
- hello(115 bytes)
- hello_world(253 bytes)
- world(115 bytes)
- md5
- Makefile(64 bytes)
- hello(6 bytes)
- hello_world(12 bytes)
- world(6 bytes)
- .biomake
- md5.time
- .biomake
- md5
- hello(115 bytes)
- hello_world(253 bytes)
- world(115 bytes)
- md5
- Makefile(64 bytes)
- hello(6 bytes)
- hello_world(12 bytes)
- world(6 bytes)
- .biomake
- md5.touch
- .biomake
- md5
- hello(115 bytes)
- hello_world(253 bytes)
- world(115 bytes)
- md5
- Makefile(64 bytes)
- hello(6 bytes)
- hello_world(12 bytes)
- world(6 bytes)
- .biomake
- md5.wrong
- .biomake
- md5
- hello(115 bytes)
- hello_world(253 bytes)
- world(115 bytes)
- md5
- Makefile(64 bytes)
- hello(6 bytes)
- hello_world(12 bytes)
- world(6 bytes)
- .biomake
- md5_avoid_update(18 bytes)
- mismatch_dcg_test(41 bytes)
- multi_arg(18 bytes)
- multi_matches_abc.def.ghi.jkl(22 bytes)
- multi_targets_from_var(47 bytes)
- multiline_depgoal_a_x(36 bytes)
- multiline_depgoal_c_b(18 bytes)
- multiline_depgoal_x_b(36 bytes)
- multiple.wildcards.baz(42 bytes)
- multiply(8 bytes)
- nested_ifeq_ifneq(48 bytes)
- nested_ifeq_include(16 bytes)
- newer_dep(18 bytes)
- notdir(6 bytes)
- old_file_dep(11 bytes)
- old_file_target(11 bytes)
- older_dep(11 bytes)
- one_line(19 bytes)
- one_line_with_deps(19 bytes)
- oneshell(18 bytes)
- oneshell_control(21 bytes)
- or1(4 bytes)
- or2(4 bytes)
- or3(1 bytes)
- outside.theres.a.boxcar.waiting(92 bytes)
- padded_modifier(17 bytes)
- padded_modifier_from_foreach(26 bytes)
- pass_var_to_prolog(4 bytes)
- pass_var_to_prolog2(8 bytes)
- pass_var_to_prolog3(4 bytes)
- patsubst(16 bytes)
- pattern_deps_exist_but_rules_fail(56 bytes)
- percent_in_body(13 bytes)
- phony_target(62 bytes)
- prolog
- Makespec.pro(556 bytes)
- human-mouse.pair(61 bytes)
- human-zebrafish.pair(69 bytes)
- human.single(14 bytes)
- mouse-zebrafish.pair(69 bytes)
- mouse.single(14 bytes)
- zebrafish.single(18 bytes)
- reach-out,touch-faith(41 bytes)
- realpath(1 bytes)
- relative_include_path(37 bytes)
- rule_precedence_even_more_control(31 bytes)
- rule_precedence_even_more_specific(41 bytes)
- rule_precedence_generic(19 bytes)
- rule_precedence_somewhat_specific(39 bytes)
- rule_precedence_specific1(23 bytes)
- rule_precedence_specific2(23 bytes)
- rule_precedence_specific3(23 bytes)
- shell(12 bytes)
- shell_assign(12 bytes)
- silent(7 bytes)
- simple(12 bytes)
- simple_prolog(28 bytes)
- size_file_empty_dep(19 bytes)
- size_file_empty_poolq_dep(25 bytes)
- size_file_empty_test_dep(24 bytes)
- size_file_nonempty_dep(26 bytes)
- size_file_nonempty_poolq_dep(32 bytes)
- size_file_nonempty_test_dep(31 bytes)
- slash_var_in_deplist(30 bytes)
- slurmtest(12 bytes)
- sort(29 bytes)
- split_lines(26 bytes)
- split_recipe_lines(30 bytes)
- split_target_lines(48 bytes)
- stem.echo(5 bytes)
- strip(40 bytes)
- subdir
- stem_dir.txt(7 bytes)
- stem_file.txt(5 bytes)
- target_dir(7 bytes)
- target_file(12 bytes)
- subst(12 bytes)
- substref(26 bytes)
- substref_list(28 bytes)
- suffix(20 bytes)
- suppress_errors_temporarily(32 bytes)
- suppress_errors_temporarily_in_script(32 bytes)
- target1(8 bytes)
- target2(8 bytes)
- that.was.my.favourite.dress(88 bytes)
- the.head.on.the.door(81 bytes)
- they.made.you.a.moron(82 bytes)
- touch(11 bytes)
- two_lines(4 bytes)
- unbound_var(1 bytes)
- under.blue.moon.i.saw.you(89 bytes)
- upper_case_var_assignment(23 bytes)
- uptodate(15 bytes)
- value(11 bytes)
- var_in_command(9 bytes)
- var_slash_var_in_deplist(30 bytes)
- vars1(25 bytes)
- vars2(25 bytes)
- vars3(28 bytes)
- walk.right.through.the.door(88 bytes)
- what.difference.does.it.make(89 bytes)
- what_if(16 bytes)
- wildcard(36 bytes)
- wildcard_deps(48 bytes)
- wildcard_nonexistent(1 bytes)
- word2(6 bytes)
- wordlist(19 bytes)
- words(2 bytes)
- your-own-personal-jesus(32 bytes)
- sge
- fake_qdel(197 bytes)
- fake_qsub(857 bytes)
- fake_qwait(476 bytes)
- slurm
- fake_sbatch(1.4K bytes)
- fake_scancel(197 bytes)
- fake_swait(498 bytes)
- target
- Makefile(6.9K bytes)
- Makefile.argval(74 bytes)
- Makefile.bagof(326 bytes)
- Makefile.cond(2.5K bytes)
- Makefile.cond.inc1(53 bytes)
- Makefile.cond.inc2(51 bytes)
- Makefile.cyclic(199 bytes)
- Makefile.dcg(263 bytes)
- Makefile.delete(327 bytes)
- Makefile.dep_linebreak(113 bytes)
- Makefile.depchain(205 bytes)
- Makefile.dir1(47 bytes)
- Makefile.env(140 bytes)
- Makefile.goal(1.1K bytes)
- Makefile.ignore(160 bytes)
- Makefile.ignore_all(199 bytes)
- Makefile.ignore_control(188 bytes)
- Makefile.include(197 bytes)
- Makefile.include2(113 bytes)
- Makefile.md5(234 bytes)
- Makefile.modifier(149 bytes)
- Makefile.nl(105 bytes)
- Makefile.nl2(153 bytes)
- Makefile.oneshell(90 bytes)
- Makefile.oneshell_control(86 bytes)
- Makefile.patterns(1.1K bytes)
- Makefile.phony1(164 bytes)
- Makefile.phony2(195 bytes)
- Makefile.precedence(619 bytes)
- Makefile.queue(787 bytes)
- Makefile.size_file(223 bytes)
- Makefile.subdir.include(49 bytes)
- Makefile.suppress(134 bytes)
- Makefile.tab(188 bytes)
- Makefile.targetexpr(340 bytes)
- Makefile.translate(969 bytes)
- Makespec.env2(240 bytes)
- Prolog.makespec(225 bytes)
- dir1
- embedded
- Makefile(388 bytes)
- md5
- Makefile(64 bytes)
- md5.checksums
- hello(115 bytes)
- hello_world(253 bytes)
- world(115 bytes)
- md5.len
- Makefile(64 bytes)
- md5.time
- Makefile(64 bytes)
- md5.touch
- Makefile(64 bytes)
- md5.wrong
- Makefile(64 bytes)
- prolog
- Makespec.pro(556 bytes)
- subdir
- Makefile.subdir(62 bytes)
- bar
- empty(0 bytes)
- foo(0 bytes)